‘Mobilome’ Study of Antibiotic Resistance Implicates Transposon Activity
PacBioで高品質なプラスミドのアセンブリ -> 抗生物質耐性遺伝子(ARG)のより良い特徴付け -> ARGの細菌間伝播メカニズム解明、という話。対象としている細菌はNIHで単離培養されたEnterobacteriaceae。Susu Heさんがリーダー。
- 感染が広がった細菌を数年間に渡ってシークエンシングして、プラスミド中のtarget site duplication (TSD; ゲノム中のある特定のコンテキストにtransposable elementが挿入されること)を追跡した。
(https://www.slideshare.net/guest06ad101/bacterial-transposonsより引用)
ARGに対抗する手段が見つかる、、かもしれない。
PacBioのmultiplexed sequencingを使えば非常に安価にどんどん読めるだろう。
ファージやプラスミドは最近流行りつつあるように思うので、自分の論文も通るといいな。。
