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yetnoneの日記

どこぞのPh.D. student。何をやっているかと聞かれると困る。

pacbio

‘Mobilome’ Study of Antibiotic Resistance Implicates Transposon Activity

www.pacb.com PacBioで高品質なプラスミドのアセンブリ -> 抗生物質耐性遺伝子(ARG)のより良い特徴付け -> ARGの細菌間伝播メカニズム解明、という話。対象としている細菌はNIHで単離培養されたEnterobacteriaceae。Susu Heさんがリーダー。 感染が広がった…

Submitting (PacBio data) to SRA

How can I submit my (metagenomic) PacBio raw data (*.bax.h5) to the SRA database? Read the quick guide Data requirement (PacBio RS II) Submission of data from the RS II instrument requires one (1) bas.h5 file and three (3) bax.h5 files. Do…